More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3282 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  247  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  81.6 
 
 		 130 aa  208  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  72.95 
 
 		 127 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  64.75 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  62.3 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  63.11 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  65.57 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  63.64 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  59.17 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  42.74 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 122 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  45.9 
 
 		 480 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.62 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  40.34 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  39.17 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  33.94 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  40.37 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  42.17 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  35.78 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  34.71 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>