266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1470 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  68.22 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  63.03 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  53.23 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  46.59 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  42.4 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  26.02 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  42.53 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  31.07 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  29.37 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  29.37 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.56 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  35.23 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  35.04 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  39.08 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.66 
 
 		 402 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 377 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 394 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  32.95 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.53 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.53 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  33.04 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  26.4 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  37.37 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  36.05 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.95 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 123 aa  48.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  26.19 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>