More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4936 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 128 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  32.06 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  32.06 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  32.06 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  36.92 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  32.89 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  36.59 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  36.63 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.61 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  36.15 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  36.15 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 		 510 aa  67.4  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  31.47 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  39.26 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.21 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.83 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.83 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 377 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  31.97 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  30.43 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  29.37 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  30.43 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  31.36 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  31.3 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  32.67 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>