More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2159 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  55.73 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 		 176 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  38.81 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  38.02 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  34.13 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.09 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  40.15 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.82 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.82 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  31.3 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  29.37 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  34.17 
 
 		 402 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  41.51 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  34.85 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>