More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4018 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  270  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  66.15 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  61.07 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  63.36 
 
 		 131 aa  179  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  61.07 
 
 		 132 aa  173  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  62.88 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  61.54 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  60.77 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  60.45 
 
 		 137 aa  166  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  57.36 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  54.96 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  54.2 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  56.06 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  55.47 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  55.04 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  55.04 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  55.04 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.01 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  35.78 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  28.3 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  32.71 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  32.82 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  28.91 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  33.61 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  28.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  28.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  30.7 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  29.77 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>