More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3749 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  74.8 
 
 		 126 aa  199  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  60.8 
 
 		 127 aa  176  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  60.98 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  49.6 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  48.36 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  36.99 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  41.32 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  38.66 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  36.29 
 
 		 480 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  32.11 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1904  Endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.342175 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  32.11 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  31.97 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  32.2 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  29.6 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  30.59 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  34.12 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  29.25 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  34.88 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  35 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  31.9 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>