More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1302 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  260  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  88.89 
 
 		 126 aa  233  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  52.1 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  39.83 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 131 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  39.02 
 
 		 204 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 204 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 204 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 205 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 204 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  39.02 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  35.43 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  39.02 
 
 		 480 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  36.8 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.09 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  40.86 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.84 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  34.65 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  31.39 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>