More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2374 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  259  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  61.42 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  58.12 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  59.52 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  58.68 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  56.45 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 138 aa  119  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  57.01 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  52.5 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 135 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  45.54 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  51.67 
 
 		 480 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 204 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  38.4 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  38.4 
 
 		 204 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 204 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 204 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  35.88 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  45.79 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  36.64 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  40.37 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  42.2 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  42.2 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.94 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  41.28 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>