More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6043 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  92.41 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  93.79 
 
 		 145 aa  286  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  89.66 
 
 		 145 aa  278  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  89.66 
 
 		 145 aa  276  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  88.97 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  88.97 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  89.44 
 
 		 149 aa  273  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  93.43 
 
 		 140 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  93.43 
 
 		 140 aa  269  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  90.58 
 
 		 138 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  87.77 
 
 		 144 aa  263  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  87.41 
 
 		 138 aa  257  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  88.15 
 
 		 138 aa  256  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  85.93 
 
 		 138 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  86.03 
 
 		 145 aa  253  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  86.76 
 
 		 139 aa  251  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  86.72 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  82.09 
 
 		 136 aa  241  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 149 aa  187  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  61.31 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 137 aa  173  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 139 aa  166  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  54.07 
 
 		 138 aa  153  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  45.26 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  36.84 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  37.96 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  36.7 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.4 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  35.85 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.82 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.64 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  32.11 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  33.64 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  37.5 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  34.41 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  38.18 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  33.64 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.63 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  26.85 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>