More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2046 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  100 
 
 		 136 aa  283  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  86.76 
 
 		 139 aa  255  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  85.29 
 
 		 138 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  85.19 
 
 		 145 aa  250  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  84.56 
 
 		 138 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  84.33 
 
 		 145 aa  249  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  83.58 
 
 		 145 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  83.09 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  83.58 
 
 		 145 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  84.56 
 
 		 144 aa  249  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  83.09 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  83.82 
 
 		 138 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  83.58 
 
 		 145 aa  248  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  82.09 
 
 		 149 aa  246  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  82.09 
 
 		 138 aa  244  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  82.09 
 
 		 145 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  79.85 
 
 		 145 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  85.16 
 
 		 130 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  81.34 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  62.32 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  60.74 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  61.94 
 
 		 139 aa  173  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  56.93 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  51.82 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  40.54 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 142 aa  66.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  40.43 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  28.46 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  28.46 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  35.92 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  34.74 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 394 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.17 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  34.86 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  27.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  27.62 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  32.43 
 
 		 402 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  32.41 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>