More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1241 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  79.84 
 
 		 127 aa  210  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  76.15 
 
 		 132 aa  208  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  78.12 
 
 		 129 aa  207  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  75.38 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  74.62 
 
 		 132 aa  201  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  79.17 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  78.33 
 
 		 123 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  69.53 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  68.55 
 
 		 125 aa  176  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  39.67 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  38.02 
 
 		 209 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  46.46 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  42.16 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  42.42 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  40.2 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  38.05 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  37.38 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  38.05 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.8 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  41.3 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.29 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  40.21 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  43.88 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  36.94 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.04 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  35.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  39.56 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  34.78 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  32.43 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  36.04 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5003  Endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>