More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2973 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  100 
 
 		 130 aa  256  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  256  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  99.23 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  94.53 
 
 		 209 aa  224  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  44.72 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  41.51 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  41.28 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.87 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.03 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  31.03 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  31.03 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  34.86 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  36.28 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  39.78 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.04 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  36.54 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  29.31 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  34.38 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  33 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  32.14 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  39.08 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  33.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.63 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  32.41 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>