More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2169 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 148 aa  308  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  68.8 
 
 		 125 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  51.94 
 
 		 209 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  53.23 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  45.26 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 128 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  45.16 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  41.6 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  43.64 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  39.18 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  38.74 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  35.09 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4327  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2382  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433224  hitchhiker  0.00030992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  34.38 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  35.79 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  35.79 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  36.46 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  35.71 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  32.63 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  29.17 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  38.39 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  38.39 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  32.29 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  37.11 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  32.76 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  28.7 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  29.52 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  30.53 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  28.7 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  32.8 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7817  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  31.25 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  38.27 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>