More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2382 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2382  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433224  hitchhiker  0.00030992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  85.71 
 
 		 127 aa  227  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  83.2 
 
 		 132 aa  221  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  83.2 
 
 		 126 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  83.2 
 
 		 126 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4327  endoribonuclease L-PSP  82.54 
 
 		 127 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  73.6 
 
 		 119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  61.86 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  47.42 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  44.44 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  46.46 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  42 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  43.43 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  43.43 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  37.19 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  43.88 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  44 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  43 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  42 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  36.75 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  36.75 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  38.38 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  36.75 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  40.57 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.28 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  44.58 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  34.45 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  36.79 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  37.74 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>