More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0812 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  73.44 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  74.8 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  75.41 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  73.98 
 
 		 123 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  71.65 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  70.08 
 
 		 132 aa  189  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  69.53 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  68.99 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  68.29 
 
 		 125 aa  177  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  33.59 
 
 		 209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  45 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  33.06 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  36.72 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  40.37 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  38.24 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  40.62 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2382  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433224  hitchhiker  0.00030992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  37.5 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4327  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35.14 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  37.62 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  35.16 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  35.24 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  38.84 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  34.41 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  36.46 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  35.23 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.84 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  34.07 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  39.56 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  34.78 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  34.65 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>