More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05500 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  100 
 
 		 132 aa  270  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  96.97 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  90.15 
 
 		 132 aa  245  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  87.7 
 
 		 127 aa  222  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  77.17 
 
 		 129 aa  203  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  75.38 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  78.33 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  77.5 
 
 		 123 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  68.99 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  68.55 
 
 		 125 aa  170  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  40.57 
 
 		 209 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  41.51 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  43.43 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  44.44 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  43 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  41.18 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  36.59 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  39.64 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  39.56 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  44.68 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  43.3 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.04 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  37.84 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  40.86 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  38.74 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.18 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  38.46 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  39.13 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.37 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  41.59 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  34.23 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  39.56 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  43.56 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  36.52 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5003  Endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  40.22 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>