More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5003 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5003  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  47.96 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  42.2 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  39.36 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  47.78 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  35.59 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.18 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  48.81 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  37.61 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  37.27 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  41.44 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  39.45 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  35.78 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  39.78 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  48.75 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  38.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  35.59 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  38.32 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  32.73 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  36.04 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  38.74 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  40.91 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  37.96 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  43.37 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  32.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.78 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  39.29 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>