More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2281 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  95.31 
 
 
130 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  94.53 
 
 
130 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  94.53 
 
 
130 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  69.11 
 
 
128 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 
148 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 
125 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
123 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  43.09 
 
 
123 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 
140 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 
132 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 
123 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 
130 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 
129 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  41.51 
 
 
132 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 
127 aa  98.6  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  39.5 
 
 
125 aa  95.9  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  40.57 
 
 
132 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 
129 aa  94  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 
127 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 
127 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 
127 aa  72  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 
126 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 
126 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.43 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  35.77 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.84 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
133 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 
126 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 
127 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  31.9 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 
126 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 
126 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  38.6 
 
 
126 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  40.86 
 
 
143 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  33.94 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  31.03 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  30.17 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  35 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 
124 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  40.4 
 
 
130 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  31.01 
 
 
148 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  40.45 
 
 
129 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  33.66 
 
 
151 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 
129 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  35.42 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 
129 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
126 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 
150 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 
129 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  42.42 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  31.3 
 
 
128 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.66 
 
 
132 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 
129 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  37.5 
 
 
145 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  62.4  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 
125 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 
128 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
117 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 
125 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 
127 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  38.2 
 
 
129 aa  61.6  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 
134 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  38 
 
 
128 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  38 
 
 
128 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>