More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3266 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  265  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  66.1 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  63.03 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  63.03 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  63.03 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  61.34 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4327  endoribonuclease L-PSP  65.25 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2382  endoribonuclease L-PSP  61.86 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433224  hitchhiker  0.00030992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  40.57 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  43.81 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  40.82 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  43 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  42.55 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  39.22 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  38.54 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  38.24 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  38.54 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  39.58 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  40.21 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.18 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  39.78 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  38.61 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  36.27 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  35.35 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  34.02 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  39.53 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  39.53 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  39.29 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  37.62 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  42.05 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  43.94 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  43.94 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.9 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  40.28 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  32.71 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>