More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3858 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  100 
 
 		 125 aa  256  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  69.92 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  69.92 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  68.29 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 130 aa  176  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  69.35 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  71.31 
 
 		 127 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  68.55 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  39.5 
 
 		 209 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  41.28 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.56 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  42 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  43 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  38.24 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  37.5 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  34.31 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  32.32 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  32.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  32.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  37.25 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.9 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  34.82 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  36.63 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  37.62 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  32.26 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  35.23 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.31 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  29.03 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  29.03 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4327  endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  30.84 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  37.5 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  29.73 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>