More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2066 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
127 aa  254  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 
126 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  40.8 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  38.84 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  38.84 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 
124 aa  87  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 
126 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  39.5 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 
128 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  38.61 
 
 
120 aa  83.6  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 
131 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 
129 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 
131 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 
133 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
124 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 
126 aa  84  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  42.22 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.82 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  37.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  37.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  36.13 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  41.11 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  40.5 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  36.59 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  37.8 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.29 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  38.52 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  38.33 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  41.3 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  37.19 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  35.29 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  36 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  38.89 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.622366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>