More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0937 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 171 aa  349  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  49.54 
 
 		 126 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  44.04 
 
 		 131 aa  93.6  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  91.3  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 126 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  42.99 
 
 		 135 aa  89  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 128 aa  89  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  88.2  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  41.13 
 
 		 126 aa  87.8  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 115 aa  87.8  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 121 aa  86.3  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  43.64 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  42.98 
 
 		 125 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  43.52 
 
 		 125 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 127 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  43.64 
 
 		 120 aa  84.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  38.89 
 
 		 126 aa  84.3  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  43.64 
 
 		 120 aa  84.3  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 125 aa  84.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 127 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  40.91 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  36.11 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  35.19 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  40.37 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  40.37 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  37.04 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.37 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.04 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  34.26 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  34.65 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  40 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  40.37 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  40.37 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  33.07 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>