More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4796 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  237  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  45.79 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  44.86 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  42.86 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  46.23 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  42.11 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  42.86 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  45.28 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  45.28 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43.93 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  41.12 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  44.44 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  39.32 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  38.46 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  37.27 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  35.24 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  32.38 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  32.38 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  32.38 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  32.41 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  35.24 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  38.89 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  38.32 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  39.09 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>