More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5866 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  50.46 
 
 		 173 aa  123  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  49.54 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  41.13 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4315  endoribonuclease L-PSP  45.87 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.915809  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  40.35 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  40.54 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  39.64 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  40.54 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  40.74 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  35.59 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  42.48 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  41.23 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  35 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  37.96 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  36.79 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  35 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.67 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  37.72 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  35.96 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.25 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  35.09 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  35.77 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.48 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  40.35 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  40.37 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  34.21 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>