More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2625 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  279  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  92.54 
 
 		 134 aa  259  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  43.33 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  44.54 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  40.83 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  39.37 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  43.1 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  40.83 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  39.37 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  38.58 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  41.32 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  40.52 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  40.16 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  37.19 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  39.37 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  40.5 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  41.41 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  39.67 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 128 aa  91.3  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.17 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  36.97 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  39.2 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  36.22 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  36.97 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.84 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.17 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  35.83 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  35.14 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  37.93 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  39.02 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  37.07 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  36.8 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>