More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3753 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  64.57 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  39.67 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  40.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  42.86 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  42.34 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  45.76 
 
 		 126 aa  87.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  40.87 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  37.29 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  40 
 
 		 126 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  37.39 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.9 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  36.59 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  39.13 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  33.62 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  46.61 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  36.44 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  42.11 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  31.9 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  32.76 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  38.74 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  34.45 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1563  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 420 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0978172  normal  0.0977714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0087  Endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 422 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.381775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  39.34 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>