More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0087 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0087  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 422 aa  855    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.381775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1563  Endoribonuclease L-PSP  69.45 
 
 		 420 aa  623  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0978172  normal  0.0977714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0887  endoribonuclease L-PSP  63.22 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.236769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 143 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 126 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  43.81 
 
 		 125 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 126 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 124 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 129 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 126 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 127 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 126 aa  93.2  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 124 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 126 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  47.17 
 
 		 120 aa  92.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 140 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 125 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 127 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 124 aa  92  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 126 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  38.97 
 
 		 128 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 128 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 124 aa  90.9  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 129 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41.75 
 
 		 148 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  40.34 
 
 		 126 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  89.7  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  41.94 
 
 		 126 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 129 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  41.6 
 
 		 126 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  46.08 
 
 		 130 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 126 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  41.6 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  45.28 
 
 		 120 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40 
 
 		 128 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  39.5 
 
 		 126 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 129 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 127 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 128 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  44.34 
 
 		 120 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 125 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  39.52 
 
 		 127 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  40.35 
 
 		 126 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 127 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  38.66 
 
 		 126 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 127 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 127 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  40.3 
 
 		 134 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 141 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 141 aa  87  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 120 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 128 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  86.7  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  48.51 
 
 		 128 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 128 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40.86 
 
 		 124 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 126 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 128 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 128 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 126 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.75 
 
 		 127 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  47.52 
 
 		 128 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  41.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  41.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  44.66 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  43.56 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>