More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3155 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  68.8 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  51.22 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  51.22 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  47.15 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  42.74 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  41.88 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.82 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.17 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  32.67 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  38.14 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  33.6 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  36.94 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  36.94 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  37.96 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  32.54 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  36.61 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7817  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  35.42 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  31.53 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.36 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  33.96 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  33.63 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>