More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2075 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2075  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2281  translation initiation inhibitor  69.11 
 
 		 209 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3098  endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807928  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1322  translation initiation inhibitor  66.67 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2973  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3155  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  39.02 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  40 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2129  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0901999  hitchhiker  0.00790244 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0812  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1241  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.1674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001562  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05500  ribonuclease UK114  36.79 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  39.64 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.87 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  36.79 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4778  endoribonuclease L-PSP family protein  35 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2869  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  39.74 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2275  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.951203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2432  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3496  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.609638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  32.41 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  29.31 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  31.9 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.42 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  36.96 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  34.04 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  32.71 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  32.71 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.29 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2382  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433224  hitchhiker  0.00030992 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  32.32 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  27.83 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  29.73 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  33.33 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>