More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2269 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
139 aa  276  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.73 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.36 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.8 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.82 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  33.04 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  39.25 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  39.25 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  40.51 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  39.29 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  30.69 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  41.07 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  38.94 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  24.75 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  30.69 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  26.73 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  27.72 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 
377 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  29.66 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3089  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  39.58 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>