247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0736 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  99.51 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 127 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 127 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 133 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 128 aa  88.2  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 127 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 132 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 132 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 122 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 132 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35.94 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  37.72 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  27.62 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  28.04 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  28.97 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  28.04 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  32.17 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  27.1 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  25.23 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  26.17 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  26.17 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  27.1 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  25.23 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  27.1 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  27.1 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  27.18 
 
 		 139 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  30.77 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 128 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 131 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 138 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 126 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  26.17 
 
 		 138 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 133 aa  52.4  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 127 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  52  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 129 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 142 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 126 aa  52  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 142 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 131 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  31.19 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  27.87 
 
 		 129 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 128 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>