More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5545 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  74.8 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  62.1 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 127 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 127 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  55 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  52.8 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  47.58 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  40.98 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.62 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  40.5 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  41.9 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1904  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.342175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  37.19 
 
 		 480 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  39.8 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  31.45 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  33.64 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  37.69 
 
 		 500 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  36.26 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  36.26 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  27.5 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  37.65 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  25.83 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  25.83 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>