More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2660 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  87.9 
 
 		 124 aa  226  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  87.1 
 
 		 124 aa  221  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  69.92 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  67.48 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3461  endoribonuclease L-PSP  61.6 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  64.17 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  64.71 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  63.87 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  60.5 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  63.87 
 
 		 128 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1925  Endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1952  Endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  43.85 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.62 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1591  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3517  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0961471  normal  0.31713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2942  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  37.4 
 
 		 500 aa  65.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3762  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1839  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.78 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  36.07 
 
 		 480 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.84 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  31.2 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  35.19 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  27.42 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  28.23 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  32.08 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>