More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5714 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 137 aa  173  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  61.24 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  61.24 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  60.77 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  61.24 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  59.66 
 
 		 138 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  58.14 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 172 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  42.02 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  42.02 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  34.4 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  34.4 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.09 
 
 		 207 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  41.18 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  41.18 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  41.18 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  41.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  44.54 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  41.88 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  41.18 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  41.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  32.28 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  35.71 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  40.71 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  35.77 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  40.37 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  37.76 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09123  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.51 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09338  L-PSP endoribonuclease family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03420)  29.41 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.920057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  36.08 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  33.93 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  35.35 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  34.23 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>