168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1654 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 108 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  98.92 
 
 		 129 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  82.8 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  82.8 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  82.8 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  82.8 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  82.8 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  82.8 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  82.8 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  81.72 
 
 		 131 aa  167  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  81.72 
 
 		 131 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  80.65 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  79.57 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  80.65 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  74.47 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  75.27 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  73.12 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  69.15 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  60.22 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  63.44 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  62.37 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  59.14 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  56.99 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  54.84 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  58.06 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  56.99 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1661  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 38 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  48.75 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  44.57 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  44.57 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  44.57 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  45.78 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  47.56 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  46.25 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  40.7 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  45.12 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  46.25 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  46.25 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.87 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  35.87 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  35.87 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  41.77 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1494  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  41.77 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.87 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2625  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318955  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  44.44 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  42.86 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  41.43 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.97 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  40.58 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  40.58 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  40.58 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.24 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  40.58 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 126 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  38.57 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  36.78 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2169  endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  39.44 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  38.57 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  36.36 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>