247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3176 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  37.7 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  37.7 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  38.1 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  38.1 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  37.7 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  37.88 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  37.19 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  33.57 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  34.17 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  62  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  29.63 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  30.88 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  33.6 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0849  Endoribonuclease L-PSP  33.56 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  33.62 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  33.62 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  30.28 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  29.75 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  29.75 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  29.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  27.12 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  31.9 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 126 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 126 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  31.03 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>