More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3080 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  280  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  51.91 
 
 		 132 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  50.38 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  42.97 
 
 		 132 aa  119  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 137 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  37.61 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  36.75 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  35.94 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  36.36 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  36.36 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  35.61 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  35.16 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  35.61 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  35.61 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  35.61 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  35.61 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  33.59 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  33.83 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  32.79 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  32.74 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  33.63 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  33.04 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  34.55 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  34.41 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  34.55 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.28 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  33.94 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.86 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>