159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3090 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  44.17 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  42.98 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  42.98 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  39.82 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  38.39 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  38.39 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  37.84 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  37.84 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  37.84 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  37.39 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0093  endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0468551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  36.04 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 377 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  31.76 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  29.82 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  29.82 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4473  Endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.871533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  29.29 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  30.69 
 
 		 510 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04125  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 394 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.58 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1654  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>