More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1266 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  260  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  66.93 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  62.7 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  53.6 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  59.55 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  42.11 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  34.56 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  34.56 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  46.23 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  36.75 
 
 		 207 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3090  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  32.84 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  34.11 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.08 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  41.46 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  35.94 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  31.93 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6626  Putative translation initiation inhibitor yjgF family-like protein  36.22 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.708369  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  36.13 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  42.05 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  30.4 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>