288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1784 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 141 aa  293  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  28.93 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  30.97 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  30.89 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  32.08 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  29.51 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  34.69 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 124 aa  50.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  37.76 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  37.76 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  30.61 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  25.83 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  27.5 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.96 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  26.5 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  23.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  26.04 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51902  maintenance of mitochondrial DNA  32 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  23.62 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.39 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  27.35 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>