295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2595 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  80.27 
 
 		 162 aa  251  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  79.59 
 
 		 161 aa  247  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  40.27 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  34.68 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  31.47 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 510 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.06 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  30.6 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.5 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  34.65 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  27.73 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 135 aa  57  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  30.25 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  33.91 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  33.04 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>