287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3501 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  275  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  25.38 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  30.53 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  29.55 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  28.91 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  28.47 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.75 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  25.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  25.38 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2349  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.67 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2170  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.180477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  27.07 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2326  hypothetical protein  30.4 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.402119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  30 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  28.99 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  27.61 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  28.8 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2107  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00100977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  26.87 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>