More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2914 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  34.58 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  34.57 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  30.46 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  30.46 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  31.71 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  25.6 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  22.58 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.11 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  28.8 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.11 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  22.58 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  21.77 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  21.77 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  21.77 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.01 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  33.02 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  30.16 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  20.97 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  20.97 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>