187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5403 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  262  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  68.46 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  34.65 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.69 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  32.53 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  27.69 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  29.23 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  32.85 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  32 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  29.29 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  29.76 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  25.58 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.86 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.14 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  27.68 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  29.89 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  28.43 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  25.58 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  32.1 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  25.22 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  32.18 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  23.08 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  25.44 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  23.81 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  25.38 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  25.44 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  24.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  26.72 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  26.72 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  28.24 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  23.68 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  24.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  23.48 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  26.51 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  28.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>