More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0453 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  267  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  87.79 
 
 		 131 aa  238  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  84.73 
 
 		 131 aa  229  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  81.68 
 
 		 131 aa  216  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  78.63 
 
 		 133 aa  210  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  77.1 
 
 		 131 aa  207  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  74.05 
 
 		 131 aa  186  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  56.15 
 
 		 133 aa  157  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.31 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  24.43 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  24.43 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  25.76 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  24.43 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  42.7 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  24.43 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  24.43 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  23.66 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  23.66 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 127 aa  57  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  25.81 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  25.78 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  34.65 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  32.28 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02087  hypothetical protein  31.37 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  32.11 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  29.08 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>