More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02087 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02087  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2226  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2691  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.07 
 
 		 402 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  35.29 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  34.23 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  32.14 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  30.89 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  35.29 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  30.95 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  28.81 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.52 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.04 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  33.33 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  33.06 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  30.17 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.25 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  26.02 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  32.04 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  28.28 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  27.87 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0260  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>