More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2226 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2226  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02087  hypothetical protein  48.76 
 
 		 126 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2691  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 394 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.07 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  33.58 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  33.87 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  36.75 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  35.54 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.58 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.94 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  30.23 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  30.58 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  31.4 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  35.65 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  34.15 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  30.33 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  29.25 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  32.79 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  34.96 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  31.45 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  28.93 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  32.77 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  29.25 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  29.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>