More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3101 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  29.23 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  33.6 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  32.54 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  32.33 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  32.33 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  31.39 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  30.7 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  36.52 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  35.4 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.62 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  31.43 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  28.1 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  26.77 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.92 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  35.37 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>