195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6728 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  38.81 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  26.21 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  33.33 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  32 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  27.72 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  28 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  29.17 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  24.81 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  28.8 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  28.8 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  28.74 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  32.04 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  25.42 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  25.19 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  24.58 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  27.45 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  23.73 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  23.73 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  28.57 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  28.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  30.89 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  24.21 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  32.28 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  30.86 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  34.52 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  28.45 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  27.12 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  25.44 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  25.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  29.75 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  27.62 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  34.94 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>