182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4615 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2385  Endoribonuclease L-PSP  64.57 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094696  hitchhiker  0.000676577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1784  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.164799  normal  0.0106753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3706  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.804369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  33.67 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28.07 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2553  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4669  Endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.570729 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.79 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  26.32 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  30.65 
 
 		 402 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 227 aa  50.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.07 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  41.38 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3055  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  41.38 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  24.56 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  32.32 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  28.83 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  39.66 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  32.99 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  29.84 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  30.93 
 
 		 392 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  34.18 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  29.59 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  26.27 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  26.42 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  28.04 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  27.27 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  25.69 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>